Python / numpy> Lesen Sie die Datendatei mit der Elementnamenzeile> Verwenden Sie genfromtxt ()

Betriebsumgebung

GeForce GTX 1070 (8GB)
ASRock Z170M Pro4S [Intel Z170chipset]
Ubuntu 14.04 LTS desktop amd64
TensorFlow v0.11
cuDNN v5.1 for Linux
CUDA v8.0
Python 2.7.6
IPython 5.1.0 -- An enhanced Interactive Python.
gcc (Ubuntu 4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) 4.8.4
GNU bash, version 4.3.8(1)-release (x86_64-pc-linux-gnu)

Zieldatei

Ich möchte den Wert einer Datei wie folgt lesen.

$ head IntField-Y 
x y z |E|^2 Ex.r Ex.i Ey.r Ey.i Ez.r Ez.i
-0.2094395102 -1.466076572 -5.235987756 1.117036835 -0.02405501404 0.01851210121 0.4265089085 0.9619413614 0.0789243352 -0.05143356113
0.2094395102 -1.466076572 -5.235987756 1.117036835 0.02405501406 -0.01851210123 0.4265089085 0.9619413614 0.0789243352 -0.05143356113
-1.047197551 -1.047197551 -5.235987756 1.080829273 -0.03701212691 0.09467516163 0.4467058558 0.9303997369 0.0629824475 -0.0365979255
-0.6283185307 -1.047197551 -5.235987756 0.8888575386 -0.01687903824 -0.0712841231 0.4031262231 0.8443906708 0.08152662539 -0.0365822794
-0.2094395102 -1.047197551 -5.235987756 1.355786123 0.000532696637 -0.07408332312 0.2568592009 1.131470229 0.05970715325 -0.02304404718
0.2094395102 -1.047197551 -5.235987756 1.355786123 -0.0005326966253 0.0740833231 0.256859201 1.131470229 0.05970715325 -0.02304404718
0.6283185307 -1.047197551 -5.235987756 0.8888575386 0.01687903825 0.07128412309 0.4031262231 0.8443906708 0.08152662538 -0.0365822794
1.047197551 -1.047197551 -5.235987756 1.080829273 0.03701212691 -0.09467516164 0.4467058558 0.9303997368 0.06298244747 -0.03659792549
-1.047197551 -0.6283185307 -5.235987756 1.699276704 -0.02108930862 -0.06464253993 0.3399972729 1.255779421 0.04140882396 -0.01893399186

Das Trennzeichen ist ein Leerzeichen, kein Komma.

Referenz

http://www.mwsoft.jp/programming/numpy/csv.html

loadtxt ()> Fehler

test_read_170418a.py

import numpy as np

data = np.loadtxt('IntField-Y', delimiter=' ')
print(data[:,0])  # 1st columne
print(data[:,1])  # 2nd columne

run

$ python test_read_170418a.py 
Traceback (most recent call last):
  File "test_read_170418a.py", line 9, in <module>
    data = np.loadtxt('IntField-Y', delimiter=' ')
  File "/home/user/tensorflow-GPU/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/lib/npyio.py", line 930, in loadtxt
    items = [conv(val) for (conv, val) in zip(converters, vals)]
  File "/home/user/tensorflow-GPU/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/lib/npyio.py", line 659, in floatconv
    return float(x)
ValueError: could not convert string to float: x
[1]+Subl-Test beenden_read_170418a.py

Artikelnamenzeile(x y z |E|^2 Ex.r Ex.i Ey.r Ey.i Ez.r Ez.i)Ich bekomme eine Fehlermeldung.

genfromtxt ()> Erfolg

test_read_170419a.py

import numpy as np

#data = np.loadtxt('IntField-Y', delimiter=' ')
data = np.genfromtxt('IntField-Y', delimiter=' ')
print(data[:,0])  # 1st columne
print(data[:,1])  # 2nd columne

run

$ python test_read_170419a.py 
[        nan -0.20943951  0.20943951 ...,  1.04719755 -0.20943951
  0.20943951]
[        nan -1.46607657 -1.46607657 ...,  1.04719755  1.46607657
  1.46607657]

Mit genfromtxt () konnte ich eine durch Leerzeichen getrennte Datendatei mit einer Reihe von Elementnamen lesen. Die Zeichenfolge in der Zeile des Elementnamens ist nan, aber es gibt kein Problem, da sie nicht als Daten behandelt wird.