4.5 References Bis 4.4
Another common annotation related to a sequence is a reference to a journal or other published work dealing with the sequence. ** Es gibt eine Referenz als Anmerkung für ein anderes Array. ** **.
We have a fairly simple way of representing a Reference in Biopython – we have a Bio.SeqFeature. ** Wir können Referenzen auf sehr einfache Weise darstellen. - Zum Beispiel Bio.Seq Feature ** Reference class that stores the relevant information about a reference as attributes of an object. ** Die Referenzklasse kann referenzbezogene Informationen enthalten. ** **.
The attributes include things that you would expect to see in a reference like journal, title and authors. ** Das Referenzattribut enthält Informationen zu Journalname, Titel und Autor. ** **.
Additionally, it also can hold the medline_id and pubmed_id and a comment about the reference. These are all accessed simply as attributes of the object. ** Außerdem können Sie Kommentare zu medline_id, pubmed_id und Referenzen behalten. Und es ist einfach, auf ähnliche Attribute zuzugreifen. ** **.
A reference also has a location object so that it can specify a particular location on the sequence that the reference refers to. ** Da die Referenz auch einen Speicherort hat, können Sie die Reihenfolge des referenzierten Dokuments nach Speicherort angeben. ** **. For instance, you might have a journal that is dealing with a particular gene located on a BAC, and want to specify that it only refers to this position exactly. ** Wenn in einem Dokument beispielsweise ein bestimmtes Gen auf einem künstlichen Chromosom erwähnt wird, können Sie es einfach anhand der Position lokalisieren. ** **. The location is a potentially fuzzy location, as described in section 4.3.2. ** Wie in 4.3.2 eingeführt, kann der Ort ein unscharfer Ort sein. ** **.
Any reference objects are stored as a list in the SeqRecord object’s annotations dictionary under the key “references”. ** Referenz ist ein Listentyp und wird im Annotations-Wörterbuchtyp von SeqRecord gespeichert. Der Schlüssel des Wörterbuchs ist "Referenzen". ** **.
That’s all there is too it. References are meant to be easy to deal with, and hopefully general enough to cover lots of usage cases. ** Es ist einfach die Sache. Die Referenz ist sehr einfach zu verwenden, daher hoffe ich, dass sie in vielerlei Hinsicht nützlich sein wird. ** **.
Recommended Posts