4.5 References Vers 4.4
Another common annotation related to a sequence is a reference to a journal or other published work dealing with the sequence. ** Il existe une référence comme annotation pour un autre tableau. ** **
We have a fairly simple way of representing a Reference in Biopython – we have a Bio.SeqFeature. ** Nous pouvons représenter les références de manière très simple. --Par exemple, Bio.Seq Feature ** Reference class that stores the relevant information about a reference as attributes of an object. ** La classe de référence peut stocker des informations relatives à la référence. ** **
The attributes include things that you would expect to see in a reference like journal, title and authors. ** L'attribut de référence contient le nom du journal, le titre et les informations sur l'auteur. ** **
Additionally, it also can hold the medline_id and pubmed_id and a comment about the reference. These are all accessed simply as attributes of the object. ** De plus, vous pouvez conserver les commentaires sur medline_id, pubmed_id et les références. Et il est facile d'accéder comme attribut. ** **
A reference also has a location object so that it can specify a particular location on the sequence that the reference refers to. ** Étant donné que la référence a également un emplacement, vous pouvez spécifier la séquence du document référencé par emplacement. ** ** For instance, you might have a journal that is dealing with a particular gene located on a BAC, and want to specify that it only refers to this position exactly. ** Par exemple, si un document mentionne un gène particulier sur un chromosome artificiel, vous pouvez simplement utiliser l'emplacement pour le localiser. ** ** The location is a potentially fuzzy location, as described in section 4.3.2. ** Comme introduit dans 4.3.2, l'emplacement peut être un emplacement flou. ** **
Any reference objects are stored as a list in the SeqRecord object’s annotations dictionary under the key “references”. ** reference est un type de liste et est stockée dans le type de dictionnaire d'annotations de SeqRecord. La clé du dictionnaire est «références». ** **
That’s all there is too it. References are meant to be easy to deal with, and hopefully general enough to cover lots of usage cases. ** C'est juste la chose. La référence est très facile à utiliser, j'espère donc qu'elle sera utile à bien des égards. ** **
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