(Ceci est une réimpression de l'article que j'ai écrit sur mon blog)

Post-scriptum: 2020/4/17

@ hirosys-biz a publié la procédure pour créer automatiquement un environnement avec CloudFormation. Il résout également la «mauvaise» partie de cet article, alors assurez-vous de le consulter également. L'environnement de participation au projet d'analyse du COVID-19 (SARS-CoV-2) a été automatiquement construit par CloudFormation

introduction

"Entraînons-nous à créer un environnement Amazon Web Service tout en contribuant à l'analyse du nouveau virus corona." En conséquence, je suis arrivé à la conclusion que "cela fonctionnait normalement, mais je ne pouvais pas beaucoup contribuer à cause du manque de spécifications dans l'offre gratuite". Gardez une trace de votre travail.

Contexte

La mode Corona est épicée. N'est-il pas possible de le résoudre plus tôt?

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Article PC Watch "Comment utiliser" Folding @ home ", qui contribue à l'analyse corona qui peut être lancée en 3 minutes même maintenant" Trouver

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Installez immédiatement sur votre ordinateur portable domestique (avec GPU de génération précédente). Je cours depuis environ une semaine et j'ai effectué environ 25 tâches, mais je ne me sens toujours pas satisfaisant.

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Je ne peux pas augmenter les spécifications, donc je veux augmenter le nombre d'unités en fonctionnement. Mais je n'ai qu'une seule machine physique ...

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Oui, j'avais un compte AWS. Utilisons ceci. Si vous pouvez le faire dans le cadre libre, quelqu'un peut-il l'imiter si vous en faites un article?

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Action.

Ce que j'ai fait ①: Créer un environnement VPC

J'ai décidé de créer d'abord un environnement VPC, puis d'y installer un environnement EC2. En gros, travaillez selon cet article de blog.

Seul le groupe de sécurité a été modifié comme suit en fonction de l'objectif d'utilisation cette fois.

Le port 80 est fermé car nous ne configurons pas de service Web.
À la place, ouvrez 7396 pour le contrôleur Web Folding @ Home
Par mesure de sécurité, ouvrez les ports SSH autres que le n ° 22 et laissez le n ° 22 pour la connexion initiale.
Cet environnement est "vous seul pouvez accéder", donc toutes les sources sont limitées à Mon IP

Ce que j'ai fait (2): créer un environnement EC2 sur VPC

Créez un environnement EC2 sur l'environnement VPC créé dans ①. Ce travail faisait également référence à cet article de blog.

Cette fois, je voulais créer un environnement qui peut être créé avec un cadre d'utilisation gratuit, donc la configuration est la suivante

OS: Amazon Linux 2 AMI(x86)
Type d'instance: t2.micro
Stockage: SSD à usage général 8 Go

Ce que j'ai fait ③: Paramètres Linux

Changer le numéro de port SSH

$ sudo vi /etc/ssh/sshd_config

###Ajoutez ce qui suit autour de 22 lignes(Numéro de port spécifié dans ①)
Port 2****

###Après avoir enregistré
$ sudo service sshd reload

Créez un compte avec une clé RSA différente de celle lors de la création d'EC2 et supprimez le "ec2-user" par défaut

###Création d'un nouvel utilisateur(privilèges root)
# useradd newuser
# passwd newuser

###Paramètres SSH(privilèges root)
# cd /home/newuser/
# mkdir .ssh
# chmod 700 .ssh
# chown newuser:newuser .ssh
###Envoyez la clé publique ici avec SCP
# mv /home/ec2-user/id_rsa.pub .ssh/authorized_keys
# chmod 600 .ssh/authorized_keys
# chown newuser:newuser .ssh/authorized_keys

###Donner la permission à sudo
# usermod -aG wheel newuser

###Dans une autre fenêtre"newuser"Se connecter en tant que. Après cela, utilisez l'écran du côté nouvel utilisateur
$ sudo su -
###Après avoir confirmé que vous pouvez devenir root, ec2-suppression de l'utilisateur
# userdel ec2-user

Ce que j'ai fait ④: Présentation de Folding @ Home

Cette fois, seul le minimum requis «FAH Client» est introduit.

Installation

$ wget https://download.foldingathome.org/releases/public/release/fahclient/centos-6.7-64bit/v7.6/fahclient-7.6.9-1.x86_64.rpm
$ sudo rpm -i --nodeps fahclient-7.6.9-1.x86_64.rpm

Réglage
Editez / etc / fahclient / config.xml. L'autorité racine est requise pour la mise à jour.

<config>
  <!-- Client Control -->
  <fold-anon v='true'/>

  <!-- Folding Slot Configuration -->
  <!-- v7.6.9-COVID pour cause après 1-Si vous spécifiez 19, les tâches liées à la couronne seront attribuées de préférence.-->
  <cause v='COVID_19'/>
  <gpu v='false'/>

  <!--Accéder aux paramètres d'autorisation pour le contrôleur Web. xxx.xxx.xxx.Entrez votre adresse IP à la place de xxx-->
  <allow>127.0.0.1 xxx.xxx.xxx.xxx</allow>
  <web-allow>127.0.0.1 xxx.xxx.xxx.xxx</web-allow>

  <!--Combien de ressources CPU sont utilisées? lumière,middle,3 choix de plein-->
  <power v='full'/>

  <!-- User Information -->
  <!--Informations de l'utilisateur. Si vous entrez le nom d'utilisateur, le montant de votre contribution individuelle sera agrégé-->
  <user v='deflat'/>
  <!--L'ID de l'équipe à laquelle vous souhaitez appartenir. Optionnel. Au fait, 222 est"Japan"équipe.-->
  <team v='222'/>
  <!--Optionnel. Vous pouvez obtenir plus de points en enregistrant votre adresse e-mail sur le site officiel et en définissant la clé reçue.-->
  <passkey v='***Collez la clé ici***'/>

  <!--Numéro et type d'emplacement. Cette fois, il n'y a qu'un seul processeur, alors ne vous embêtez pas-->
  <!-- Folding Slots -->
  <slot id='0' type='CPU'/>

</config>

Refléter les paramètres et redémarrer le service
Même si vous vous arrêtez pendant le traitement de la tâche, la prochaine fois que vous démarrez, il calculera correctement à partir de la suite.

$ sudo /etc/init.d/FAHClient stop
$ sudo /etc/init.d/FAHClient start

résultat

Si vous accédez à http: // <adresse IP de l'environnement EC2>: 7396 avec un navigateur Web, vous pouvez voir qu'il fonctionne correctement comme indiqué ci-dessous. ... mais ** incroyablement lent **
L'image est d'environ 24 heures après le début du traitement. Même avec un ordinateur portable personnel, cela devrait prendre 3 à 4 heures.

Ce que j'ai découvert plus tard

L'instance t2 d'EC2 a un concept de "solde de crédit CPU", et lorsqu'elle est morte, les ressources CPU qui peuvent être utilisées sont limitées.
Avec le t2-micro utilisé cette fois, le taux d'utilisation du processeur n'est que de 10%.
Il semble que si vous arrêtez l'instance elle-même → la démarrez, elle récupérera le crédit initial, donc je l'envisagerai à l'avenir.
[Référence](http://tagvote.grinspace.jp/aws%E3%81%AEt2-micro%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%82%BF%E3 % 83% B3% E3% 82% B9% E3% 81% AB% E3% 81% A4% E3% 81% 84% E3% 81% A6% EF% BC% 88% E3% 81% 8A% E3% 81 % 95% E3% 82% 89% E3% 81% 84% EF% BC% 89 /)

Résumé et impressions

«Entraînons-nous à créer un environnement Amazon Web Service tout en contribuant à l'analyse du nouveau virus corona.
Même pour la première fois, j'ai pu terminer l'ensemble du processus en 2 à 3 heures. Merci à tous nos ancêtres.
À l'avenir, j'aimerais essayer la méthode d'exécution périodique "Arrêter l'instance → Récupérer le crédit en démarrant" comme mentionné ci-dessus.
De plus, j'aimerais essayer la même chose avec d'autres services IaaS.

Journal des modifications

2020/4/20: Compatible avec la dernière version de FAH Client (Ver 7.6.9-1)

[LINUX] Une histoire sur la tentative de contribuer à l'analyse COVID-19 avec l'offre gratuite d'AWS et l'échec