Wenn mit matplotlib erstelltes EPS in dvi problemlos angezeigt wird, verschiebt sich jedoch die Position des Bildes, wenn es mit dvipdfmx in PDF konvertiert wird.
Da die Ursache und die Bedingungen der Umgebung, in der es auftritt, völlig unbekannt sind, werden nur die zufällig gefundenen Lösungen vorgestellt.
\usepackage{graphicx}
Zu
\usepackage[dvipdfmx]{graphicx}
ändern
http://mkacky.wordpress.com/2013/05/27/tex%E3%81%A7dvi%E3%81%8B%E3%82%89pdf%E3%82%92%E4%BD%9C%E6%88%90%E3%81%99%E3%82%8B%E3%81%A8%E5%9B%B3%E3%81%8C%E3%81%9A%E3%82%8C%E3%82%8B/ Die in eingeführte Methode funktionierte aufgrund eines Fehlers in Ghostscript nicht.