[PYTHON] Installieren des ChEMBL-Webresource-Clients

Einführung

Ich bin dabei, ChEMBL zu studieren. Als Ausgangspunkt habe ich eine Python-Schnittstelle namens ChEMBL-Webresource-Client gefunden und sie installiert.

Was ist der ChEMBL-Webresource-Client?

Die einzige offizielle Python-Client-Bibliothek, die von der ChEMBL-Gruppe entwickelt und unterstützt wird. Nützlich für den Zugriff auf ChEMBL-Daten und chemische Informatik-Tools von Python. Sie können es verwenden, ohne SQL oder REST zu kennen.

Installation

In der virtuellen Anaconda-Umgebung von Python3.6 konnte ich Conda wie folgt verwenden.

conda install -c conda-forge chembl_webresource_client
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done


==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
  current version: 4.7.12
  latest version: 4.8.2

Please update conda by running

    $ conda update -n base -c defaults conda



## Package Plan ##

  environment location: /home/kimisyo/anaconda3/envs/chemlearn

  added / updated specs:
    - chembl_webresource_client


The following packages will be downloaded:

    package                    |            build
    ---------------------------|-----------------
    chembl_webresource_client-0.10.0|           py36_1          89 KB  conda-forge
    easydict-1.9               |             py_0           9 KB  conda-forge
    gevent-1.4.0               |   py36h516909a_0         2.5 MB  conda-forge
    greenlet-0.4.15            |   py36h516909a_0          22 KB  conda-forge
    grequests-0.4.0            |             py_0           6 KB  conda-forge
    requests_cache-0.4.13      |             py_0          16 KB  conda-forge
    ------------------------------------------------------------
                                           Total:         2.7 MB

The following NEW packages will be INSTALLED:

  chembl_webresourc~ conda-forge/linux-64::chembl_webresource_client-0.10.0-py36_1
  easydict           conda-forge/noarch::easydict-1.9-py_0
  gevent             conda-forge/linux-64::gevent-1.4.0-py36h516909a_0
  greenlet           conda-forge/linux-64::greenlet-0.4.15-py36h516909a_0
  grequests          conda-forge/noarch::grequests-0.4.0-py_0
  requests_cache     conda-forge/noarch::requests_cache-0.4.13-py_0


Proceed ([y]/n)? y


Downloading and Extracting Packages
easydict-1.9         | 9 KB      | ##################################################### | 100%
greenlet-0.4.15      | 22 KB     | ##################################################### | 100%
gevent-1.4.0         | 2.5 MB    | ##################################################### | 100%
chembl_webresource_c | 89 KB     | ##################################################### | 100%
grequests-0.4.0      | 6 KB      | ##################################################### | 100%
requests_cache-0.4.1 | 16 KB     | ##################################################### | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done

Der Eindruck, dass ich es versucht habe, ist getrennt.

Referenz

• https://github.com/chembl/chembl_webresource_client