[PYTHON] Tout en étudiant les pandas, j'ai fait une étude gratuite sur la fin de Corona et si le verrouillage était significatif.
Corona prendra fin.
Cela fait un mois que la déclaration d'urgence pour le virus corona a été publiée. Depuis que je travaille en Europe pour la recherche, je souffre de ce virus depuis la mi-mars. Les emplois en Europe ne sont plus dans cette tourmente, et même si je cherche un emploi au Japon, il est difficile d'obtenir une réponse de tout le monde. (Merci pour le fait que c'est GW et c'est naturel.) C'est une perte de temps de passer du temps à la maison, alors j'ai fait des recherches gratuites pour voir si Corona allait s'arrêter, ainsi que pour étudier les pandas.
Quoi utiliser
Ourworld dans la base de données Data Corona (basée sur CSV)
Seulement c'était facile et je n'ai pas pu trouver un bon gars. Veuillez enseigner si vous avez une bonne base de données. https://github.com/owid/covid-19-data/blob/master/public/data/owid-covid-data.csv
Page de verrouillage de Wikipédia
https://en.wikipedia.org/wiki/Curfews_and_lockdowns_related_to_the_2019%E2%80%9320_coronavirus_pandemic#cite_note-51
Jupyter et les pandas
Puisque ce domaine est M. qiita, je vais omettre l'introduction.
Préparation des données
Commencez par cuire la page Wikipédia en csv.
C'est vraiment dur.
Lire csv et organiser les données par pays
df=pd.read_csv('/home/username/COVID19/owid-covid-data.csv')
df.date = pd.to_datetime(df['date'], format='%Y-%m-%d')
countries=pd.read_csv('/home/username/COVID19/countries.csv')
countries.lockdown_begins=pd.to_datetime(countries['lockdown_begins'], format='%Y-%m-%d')
countries.lockdown_ends=pd.to_datetime(countries['lockdown_ends'], format='%Y-%m-%d')
countries=countries.dropna()
countries.index=countries.iso_code
Quand j'entre dans les pandas, ça ressemble à ça (j'ai un peu foiré l'index)
Pour Wiki (date de début de verrouillage, date de fin (prévue))
Données brutes
Prenez un sous-ensemble des données par pays et indexez la date
def country(df,country_name):
newdata=df.loc[df.iso_code==country_name]
newdata.set_index(['date'],inplace=True)
return newdata
Jouons maintenant avec les données.
Tout va bien alors complotons
Alors, faisons un graphique du nombre d'infections confirmées, de la date et de l'heure du décès et du total cumulé, que nous voyons souvent. Après tout, la moyenne mobile sur 7 jours semble être bonne pour éviter les données du samedi et du dimanche. Calculons la moyenne mobile sur 7 jours et le taux positif.
def rolling_average(input):
columns=input.columns
input['new_tests2']=input['total_tests'].diff()
for column in columns[2:13]:
#La moyenne mobile est-elle correcte dans cette ligne?
input[column]=input[column].rolling(7).mean()
#Le taux positif cumulé et le taux positif quotidien sont calculés à partir de la moyenne mobile de tous les cas et du nombre de tests (nombre de personnes).
input['positive_rate_total']=input['total_cases']/input['total_tests']
input['positive_rate_diff']=input['new_cases']/input['new_tests2']
return input
Le nombre de personnes nouvellement infectées sur la moyenne mobile est en baisse, et le nombre de décès est susceptible de dépasser le passage. C'est exactement ce que font les nouvelles. (Au 3 mai)
Comme indiqué, le taux de PCR positif quotidien semble être d'environ 10% pour l'ensemble du pays. Si les données ne concernent que Tokyo, ce sera tout à fait différent.
Sujet principal 1 Quel est l'effet du verrouillage?
Maintenant que la nouvelle a été reproduite sur jupyter, examinons sa relation avec le verrouillage. Je l'ai regardé tout le temps (j'ai vérifié tous les jours pendant les trois premières semaines de mon séjour en Europe) Article gratuit du Financial Times pour le moment Tracons en fonction du jour où la moyenne mobile des morts est devenue 3 personnes en référence à. Il s'agit de la date de référence pour la propagation du coronavirus dans cette étude gratuite. Tous les graphiques sont divisés par la valeur maximale (la valeur avec le nombre maximal d'infectés ou de morts).
Le lendemain du jour où la déclaration d'urgence a été annoncée (4/6), 4/7 était le jour où il y avait trois personnes, et le Japon était sur le graphique de la mort du Financial Times, qui n'avait pas été à ce jour. Cela est apparu et c'était extrêmement douloureux. J'ai imaginé une situation dans laquelle une explosion d'infection tuerait des dizaines de milliers de personnes au Japon, et j'ai tremblé. Heureusement, cependant, je pense que c'est vers le 17 avril que j'ai été un peu soulagé après avoir dépassé le pic des personnes nouvellement infectées en moins de deux semaines. C'était comme ça, non? Je ne peux rien dire sur le pic des décès, mais le même graphique dans d'autres pays a environ deux semaines de retard, alors ayons une observation optimiste que c'est la semaine dernière. (Le nombre de décès semble varier en fonction de la situation médicale du pays.) Et nous serons les 5/4 du 25ème jour. L'annulation de la déclaration d'urgence à la fin du mois se trouve à l'extrême droite du graphique. À première vue, le nombre de nouvelles infections confirmées semble s'installer. Bien sûr, vous pouvez faire ce chiffre à partir de différents pays. Cela dit, le contenu est le même que celui du Financial Times, alors jetons un coup d'œil à l'Angleterre et à la France, qui nous sont redevables, et à l'Australie, qui se porte bien dans les pays assez développés.
Au Royaume-Uni, huit jours après le dépassement de la moyenne mobile de trois décès, le nombre de personnes infectées et de décès a continué d'augmenter pendant les deux semaines suivantes. C'est très douloureux pour moi d'être pris en charge. À ce stade, bien sûr, il n'y a aucune chance de déverrouillage. Au fait, la ligne la plus à droite est aujourd'hui. triste.
La France était en retard dans le verrouillage, mais en imposant une interdiction stricte de sortir et des amendes pour sorties inutiles, elle a imposé une restriction significative à la circulation des personnes. L'effet est remarquable quand on le regarde maintenant, et en termes de chiffres, environ 1000 personnes sont toujours confirmées comme infectées chaque jour, mais le nombre de personnes nouvellement infectées diminue à 20% dans le pire des cas, et le nombre de décès diminue. À ce moment-là, j'étais déconcerté par la rigueur de l'interdiction de sortir, mais maintenant j'obtiens un effet très élevé. La ligne la plus à droite est la date du jour.
Je ne connais pas très bien la situation en Australie (n'est-ce pas verrouillé?), Mais il semble que les vols internationaux aient été stoppés très tôt. (Ce jour est utilisé comme un substitut à la date de début du verrouillage.) Comme vous pouvez le voir, l'effet est extrêmement élevé en Australie, où des mesures ont été prises avant les décès, et le nombre maximal de personnes infectées a pris fin avant que le nombre de morts n'atteigne trois. .. Cela signifie qu'au moment des trois morts, il a été éclairci. La ligne de droite est de 5/3 jours. Dans ce cas, si vous sortez prudemment et évitez les grappes (3 denses), vous pourrez retrouver votre vie d'origine d'ici la fin de cette année.
comment était-ce? C'est un graphique simple, mais je pense que vous pouvez voir l'importance du verrouillage et de la protection des frontières.
Sujet principal 2 Graphique dégoûtant
Apparemment, la rapidité des mesures de verrouillage et aux frontières était la clé des mesures corona. Appelant cela un nom cool, Lockdown Delta, j'ai essayé de tracer le nombre de décès et le nombre de personnes infectées dans les 50 premiers pays avec le plus grand nombre cumulatif de personnes infectées, et il n'y avait que deux chiffres intéressants. Le premier est ici. C'est un graphique très dégoûtant. Après tout, l'axe vertical représente les personnes que nous avons perdues.
(Je dis efficacité de verrouillage, mais il y a une différence entre le jour où je viens de verrouiller et le total cumulatif de 3 morts. C'est un delta de verrouillage. Lol) Le delta de verrouillage s'est verrouillé plus rapidement en allant vers la gauche et plus lentement en allant vers la droite. Indique que. Le nombre de morts maximal moyen mobile est pris verticalement. Comme vous pouvez le voir, il existe une corrélation claire sans apprentissage automatique ni tracé de ligne. Le Japon a un delta de verrouillage de -1, donc je pense que c'est un assez bon parmi d'autres pays. Il semble que la grappe de fin février et l'effet d'éviter la densité soient sortis. Il y a un débat sur la publication d'une déclaration d'urgence une semaine plus tôt, mais cela ne peut pas être aidé. Ensuite, veuillez déclarer rapidement une urgence. Ravi de vous rencontrer. </ ul> </ b> La France, l'Espagne, le Royaume-Uni, les États-Unis, etc., où le delta de verrouillage a été retardé de plus de 5 jours, semble avoir eu des résultats très sévères. Je pense que la Chine a souvent pu se verrouiller à cette vitesse sans aucune information. Cependant, la Russie et le Brésil semblent avoir des difficultés même si la période de verrouillage est à peu près la même que celle du Japon.
Quand le sujet principal se terminera-t-il?
Il s'agit de la relation entre le delta de verrouillage et la période de verrouillage à l'endroit où la couronne semble avoir convergé et où le verrouillage a été libéré.
Lorsque le delta de verrouillage est petit, le pic d'infection est rapide et le nombre de décès est faible, ce qui entraîne un court laps de temps pour libérer le verrouillage. Heureusement, la déclaration d'urgence du Japon était le verrouillage Δ = -1, de sorte que la période de verrouillage est d'environ 65 jours. J'ai tout fait en une journée, donc je n'ai pas eu le temps de tracer une ligne droite, mais j'ai le sentiment que le verrouillage peut être libéré début juin. Au contraire, ceux qui sont prêts à déménager maintenant sont toujours gentils et peuvent appeler à la prochaine vague. Continuons notre visite en mai avec Sutehome, Bisefu et Bikaind </ b> </ ul>
L'Europe compte de nombreux pays avec des deltas de verrouillage positifs, cela prendra donc du temps. Si vous tirez le dernier graphique en ligne droite, je pense que cela prendra deux fois plus. C'est dur, mais je vous soutiens. Soit dit en passant, en Australie, que j'ai présentée plus tôt, la période de verrouillage est courte parce que le verrouillage a été rapide. Y a-t-il quelque chose qui vous préoccupe? C'est vrai, la Norvège. Que ce passe-t-il? Nous allons jeter un coup d'oeil.
Le verrouillage norvégien avait une longueur d'avance sur l'Europe le 12 mars. La moyenne mobile a atteint trois le 3 avril, ce qui signifie que nous avions verrouillé il y a plus de 20 jours. Le verrouillage se termine le 13 avril, soit environ 10 jours seulement après que la moyenne mobile atteigne trois personnes. C'est une version de verrouillage assez rapide, sinon complètement revenue à la normale. Le bilan quotidien moyen des morts est de huit, et un total cumulatif de 200 personnes ont été tuées, mais c'est probablement le meilleur en Europe, où les gens se déplacent activement.
À la fin
comment était-ce? Cela peut sembler incertain en période de turbulence, mais à moins que votre pays ne devienne un point singulier, il semble que vous puissiez prédire un peu l'avenir avec une simple organisation des données. C'est ma première étude gratuite, mais s'il y a des gens qui la trouvent intéressante, je continuerai à la publier fréquemment. Je publierai la source si vous le souhaitez, mais ne vous y attendez pas car je ne suis pas un très bon programmeur. Si vous avez la chance de vous revoir, rendez-vous quelque part.