[PYTHON] Installation d'OpenMDAO (version 1.7.1)

Vue d'ensemble d'OpenMDAO

Qu'est-ce qu'OpenMDAO?

• Framework Python pour la conception, l'analyse et l'optimisation de zones complexes
• Développeur: NASA Glen Research Center
• Licence: Licence Apache 2.0
• Plateforme: Windows, Linux, OS X
• Prend en charge non seulement la méthode de gradient, mais également l'algorithme génétique et l'optimisation des groupes de particules
• Le calcul parallèle basé sur MPI est possible

Cheval de compétition

• Est-ce Dakota?

Histoire d'OpenMDAO

Comme mentionné ci-dessus, les versions 0.13 et antérieures et 1.0.0 et ultérieures sont complètement différentes. Cet article résume l'installation de la version 1.7.1. Voir slideshare here pour installer les versions antérieures à la 0.13.0, bien que ce soit un slapstick.

Installez OpenMDAO

Environnement prérequis

Il semble que Git (optionnel), Python, Pip, Numpy, Scipy devraient être installés à l'avance (non confirmé). Le document original déclare:

• OS pris en charge (OS en cours de test)

Il peut également être installé sur d'autres distributions telles que RHEL et Mint. En fait, j'ai pu l'installer sur CentOS 6.4 sans aucun problème.

• Version de chaque logiciel et package Python

Cette fois, nous utiliserons l'environnement Anaconda créé sur Ubuntu 14.04 LTS.

conda create -n py27 python=2.7 anaconda
source activate py27

Si Anaconda est installé dans l'environnement pyenv, Voir les 3 types de solutions de contournement de y_sama pour activer les problèmes de collision lorsque pyenv et anaconda coexistent.

Installation

Puisqu'il est enregistré dans PyPI, installez-le avec pip. Ne pas installer avec conda (l'ancienne version (0.13) est enregistrée dans anaconda)

pip install openmdao

Contrôle de fonctionnement

Après avoir exécuté ce qui suit, si vous pouvez confirmer l'opération check stdout, c'est OK.

PY27=`which conda`
cp ${PY27:0:-10}/lib/python2.7/site-packages/openmdao/examples/paraboloid_example.py .
python paraboloid_example.py

Contrôle de fonctionnement stdout

##############################################
Setup: Checking root problem for potential issues...
No recorders have been specified, so no data will be saved.
Setup: Check of root problem complete.
##############################################
-15.0

Installation liée à MPI

Installé avec conda. MPI de mpi4py de conda utilise MPICH2

conda install mpi4py
conda install -c mutirri petsc4py

Vérification du fonctionnement de petsc4py

Préparez les petsc4py_test.py suivants

petsc4py_test.py

from petsc4py import PETSc
rank = PETSc.COMM_WORLD.getRank()
num_ranks = PETSc.COMM_WORLD.getSize()
x = PETSc.Vec().createMPI(4) # VecCreateMPI: Creates a parallel vector.  size=4
x.setValues([0,1,2,3], [10,20,30,40]) # VecSetValues: Inserts or adds values into certain locations of a vector.  x[0]=10, x[1]=20, x[2]=30, x[3]=40
print ('Rank',rank,'has this portion of the MPI vector:', x.getArray() ) # VecGetArray: Returns a pointer to a contiguous array that contains this processor's portion of the vector data.
vec_sum = x.sum() # VecSum: Computes the sum of all the components of a vector. 10+20+30+40=100

if rank == 0:
    print ('Sum of all elements of vector x is',vec_sum,'and was computed using',num_ranks,'MPI processes.')

Après avoir exécuté ce qui suit, si vous pouvez confirmer le résultat ci-dessous, vous pouvez vérifier le fonctionnement de petsc.

mpirun -np 2 python petsc_test.py

contrôle de fonctionnement petsc

(('Rank', 1, 'has this portion of the MPI vector:',
 'Rank', 0, 'has this portion of the MPI vector:', 
array([ 10.,  20.]))
array([ 30.,  40.]))
('Sum of all elements of vector x is', 
100.0, 'and was computed using'

Vérification du fonctionnement d'OpenMDAO MPI

Après avoir exécuté ce qui suit, si la fin de log.doe est la suivante, c'est OK. (L'avertissement est envoyé à stdout)

PY27=`which conda`
cp ${PY27:0:-10}/lib/python2.7/site-packages/openmdao/examples/doe_example.py .
mpirun -np 5 python doe_example.py >log.doe
tail -10 log.doe

queue stdout

  const.c: 3.0
  dut.y: 13304.993403
  indep_var.x: 4434.99780099
Timestamp: 1480262524.502128
Iteration Coordinate: rank3:Driver|1
Iteration succeeded: yes
Unknowns:
  const.c: 3.0
  dut.y: 13266.2297346
  indep_var.x: 4422.07657819

Résumé

• OpenMDAO décrit
• OpenMDAO a été installé et son fonctionnement a été confirmé.