Ich habe eine Posterpräsentation zu dem eingereichten Artikel "Bemühungen zur Verhinderung der Reaktivierung des Hepatitis B-Virus bei immunsuppressiver / Krebs-Chemotherapie mit DWH, PostgreSQL und Pandas" gehalten.
Die Posterpräsentation besteht darin, zunächst eine Arbeit (Zusammenfassung) bei einer akademischen Gesellschaft einzureichen, ein Poster für die Präsentation der angenommenen Zusammenfassung zu erstellen und den Inhalt in ca. 5 Minuten kurz zu erläutern. Ich war ziemlich nervös, weil ich noch nie eine solche Präsentation auf einer Konferenz gemacht hatte, aber ich habe es geschafft, sie zu bekommen.
Um einen Überprüfungsmechanismus für eine bestimmte Krankheit zu erstellen, werden die erforderlichen Daten aus der elektronischen Diagrammdatenbank (DWH) extrahiert und der Prozess zur Erstellung von Warnungsdateien mithilfe von SQL- und Skriptsprachen automatisiert. Ich glaube, ich mache etwas ziemlich Fortgeschrittenes, wie zum Beispiel ein Jupyter-Notebook. Der Zweck dieses Systems besteht darin, Warnmeldungen zu erstellen, die Kliniken dazu ermutigen, Nukleinsäureanaloga zu verabreichen oder mit den erforderlichen Tests zu überwachen, um eine Reaktivierung von Hepatitis B zu verhindern. Als Prozedur
Datenextraktion aus elektronischem Diagramm DWH (Extraktion von Patienten, die ein Zielarzneimittel erhalten) ⇩ In PostgreSQL gespeichert ⇩ Wird bei Bedarf in Steroid umgewandelt ⇩ Abfrageausführung mit Python (Pandas) ⇩ Sammeln Sie Abfrageergebnisse in einer Warnungsdatei (mit Python)
Es ist geworden. Der Algorithmus basiert auf den von der japanischen Gesellschaft für Hepatologie formulierten "Richtlinien für Gegenmaßnahmen gegen Hepatitis B durch Immunsuppression und Chemotherapie". http://www.jsh.or.jp/files/uploads/R2-HBV%20Ver2.2.pdf Ein Teil der erstellten SQL-Anweisung und des Python-Codes wurde auf github veröffentlicht. https://github.com/riow1983/HBV-R
Insbesondere zeichnet es sich dadurch aus, dass es mit der Steroidumwandlung kompatibel ist. Viele ähnliche Operationen wurden berichtet, aber wir konnten den Steroidtiter von Steroiden nicht genau erfassen. Jede medizinische Einrichtung, die PostgreSQL und ein Jupiter-Notebook von Open Source verwendet, ist durch den Ort gekennzeichnet, an dem sie verfügbar ist. In Zukunft möchte ich einen dedizierten Server in das HIS-Netzwerk einführen, um weitere Arbeit zu sparen und das Backup-System zu stärken.
Recommended Posts