[LINUX] Holen Sie sich mit QIIME2 die Korrespondenztabelle des OTU-Namens und seiner Abstammung (Tor, Familie, Gattung usw.)

In Vorheriger Artikel habe ich geschrieben, wie OTU-Zähldaten abgerufen werden, aber in vielen anderen Fällen als der Diversity-Analyse basiert es auf diesem System. Ich denke, wir werden die Daten diskutieren.

Dieses Mal werde ich darüber schreiben, wie die Korrespondenztabelle von OTU und seinem System mit QIIME2 abgerufen werden kann.

Ehrlich gesagt ist es für diejenigen, die QIIME2 einmal berührt haben, überhaupt nicht schwierig. Persönlich habe ich diesen Artikel geschrieben, um diesen Artikel zu zitieren, wenn ich in Zukunft verschiedene Analysen mit Stammnamen veröffentliche.

Öffnen Sie taxonomy.qzv auf QIIME2 (im Browser anzeigen) gemäß den offiziellen Tutorials (https://docs.qiime2.org/2020.6/tutorials/moving-pictures/).

QIIME2

qiime tools view taxonomy.qzv

Diesmal zur Erläuterung [dieser Link](https://view.qiime2.org/?src=https%3A%2F%2Fdocs.qiime2.org%2F2020.6%2Fdata%2Ftutorials%2Fmoving-pictures % 2Ftaxonomy.qzv), damit die Beispieldaten taxonomy.qzv an die im Browser angezeigte Stelle gesprungen werden können.

Die erste Spalte ist die OTU-ID, die zweite Spalte ist der Systemname und die dritte Spalte ist die Zuverlässigkeit (siehe [hier](https://forum.qiime2.org/t/how-is-the-confidence-calculated- für Details). With-Taxa-Zuweisungen / 179)).

Klicken Sie oben links auf "Metadaten-TSV-Datei herunterladen", um die Korrespondenztabelle als .tsv (Textdatei) herunterzuladen.